El sistema de seguridad está compuesto por válvulas de seccionamiento y válvulas de seguridad.

Con el objeto de proveer de un sistema de seguridad a cada tramo de sus gasoductos, Promigas dispone de válvulas de seccionamiento equipadas con actuadores hidroneumáticos y/o electrónicos con cierre automático por alta y baja presión de gas y corte por velocidad de caída de presión, distribuidas a lo largo de los dos subsistemas Ballena-Cartagena y Cartagena-Jobo.  Adicionalmente, la mayoría de estos equipos son monitoreados en tiempo real a través del sistema SCADA del gasoducto, lo que facilita la toma de decisiones de manera inmediata.

Promigas también tiene instaladas válvulas de seguridad en sus estaciones de recibo y envío de gas, como son las estaciones Palomino, Arenosa, Caracolí, Paiva,​ La Heroica, Mamonal, Filadelfia y Sahagún que permiten sortear cualquier situación de sobrepresión del gasoducto, mediante venteo a la atmósfera del gas en exceso que se encuentre en el sistema.

Cada una de las válvulas de seccionamiento del sistema de transporte cuenta con un cerramiento que protege la integridad física de las válvulas.
 
Los cerramientos están dotados de un sistema de alarma sonoro y de aviso de activación remoto, que al ser activados, se genera la respectiva señal de alarma en el Centro de Información de S​​eguridad (CIS) de Promigas.​